ศูนย์พุทธศาสน์ศึกษาจัดตั้งขึ้นอย่างเป็นทางการเมื่อวันที่ 26 สิงหาคม 2536 โดยมีวัตถุประสงค์เพื่อส่งเสริมการศึกษา ค้นคว้า เผยแพร่ความรู้เกี่ยวกับพระพุทธศาสนา และวิจัยพระพุทธศาสนาตามแผนงานของโครงการการวิจัยที่นักวิชาการทั้งภายในและภายนอกมีความสนใจ
นอกจากนี้ยังเป็นศูนย์กลางระดมความคิดเพื่อหาแนวทางประยุกต์พระพุทธศาสนากับปัญหาของสังคม ตลอดจนเป็นศูนย์กลางของสารนิเทศและการศึกษาวิจัยในด้านพระพุทธศาสนาทั้งในระดับชาติและระดับสากล ในการเผยแพร่และแลกเปลี่ยนความรู้ทางวิชาการ ศูนย์พุทธศาสน์ศึกษาได้จัดพิมพ์วารสารทางวิชาการเกี่ยวกับพุทธศาสน์ศึกษาราย4 เดือน เป็นภาษาไทย และภาษาอังกฤษ จัดแปลคัมภีร์พระพุทธศาสนา จัดแปลผลงานนักวิชาการไทยเป็นภาษาต่างประเทศ จัดอบรมครูผู้สอนวิชาพระพุทธศาสนาในโรงเรียนต่าง ๆ นอกจากนี้ ศูนย์พุทธศาสน์ศึกษายังเปิดสอนพุทธธรรมเป็นภาษาอังกฤษ

ด้านการบริการวิชาการศูนย์พุทธศาสน์ศึกษาได้จัดตั้งห้องสมุดรวบรวมผลงานวิชาการด้านพระพุทธศาสนาของนักวิชาการทั้งในและต่างประเทศเพื่อเป็นแหล่งส่งเสริมการศึกษา ค้นคว้าและเผยแพร่ความรู้เกี่ยวกับพระพุทธศาสนา