มีภาควิชาซึ่งรับผิดชอบในการเปิดสอนหลักสูตรต่างๆ 7 ภาควิชา คือ

• ภาควิชาวิทยาการเภสัชกรรมและเภสัชอุตสาหกรรม
• ภาควิชาเภสัชกรรมปฏิบัติ
• ภาควิชาเภสัชศสตร์สังคมและบริหาร
• ภาควิชาอาหารและเภสัชเคมี
• ภาควิชาเภสัชเวทและเภสัชพฤษศาสตร์
• ภาควิชาชีวเคมีและจุลชีววิทยา
• ภาควิชาเภสัชวิทยาและสรีรวิทยา