พิพิธภัณฑสถานนี้เป็นแหล่งร่วมมือ และแลกเปลี่ยนทางวิชาการกับพิพิธภัณฑสถานเช่นเดียวกับในแหล่งอื่น ๆ ทั่วโลก โดยในเบื้องต้นนี้มีพิพิธสถานสมุนไพรของ Institute of Oriental Medicine Research, Toyama Medical and Pharmaceutical University เมือง Toyama ประเทศญี่ปุ่น ทำหน้าที่เป็น sister institute

เนื้อหาที่จัดแสดง :

1. ประวัติเภสัชกรรม และอุปกรณ์การทำยาไทยตั้งแต่สมัยทวาราวดี และวิวัฒนาการจนถึงปัจจุบัน กระบองอาญาสิทธิ์และย่ามแดงของแพทย์หลวง เครื่องบดยา เครื่องทำยาเม็ดและยาแคปซูล เครื่องชั่ง ตวง วัด ฯลฯ
2. เครื่องยาไทยและวิวัฒนาการรูปแบบการใช้ยาจากสมุนไพร
3. ฐานข้อมูลต่าง ๆ ของสมุนไพรที่น่าสนใจจากคอมพิวเตอร์ แสดงรูปภาพ สรรพคุณ สารเคมีที่ออกฤทธิ์ วิธีการใช้และข้อควรระวัง
4. วิดีทัศน์เกี่ยวกับสมุนไพรที่น่าสนใจ และประวัติเภสัชกรรมไทย